La Ville de Fredericton est administrée par un conseil municipal constitué du maire, nommé et élu au suffrage populaire, et de 12 conseillers municipaux, nommés et élus par quartier. Le maire et les conseillers municipaux sont élus pour un mandat de quatre ans.
Le conseil municipal est responsable de l'administration des affaires municipales. Pour se faire, il tient des réunions du conseil municipal, du comité plénier, du comité permanent et d'autres comités et commissions.
Le fonctionnement de la Ville de Fredericton est régi par les arrêtés municipaux. La municipalité est également régie par les dispositions de la Loi sur la gouvernance locale, de la Loi sur l’urbanisme, de la Loi sur les langues officielles et de la Loi sur le droit à l’information et la protection de la vie privée du Nouveau-Brunswick.
Le budget est basé sur l'année civile. Le conseil approuve un budget annuel d'immobilisation et de fonctionnement pour le fonds d'administration générale et pour le Service d'eau et d'égout.